Retroviry

Retroviry
	Virus HIV - mikrofotografie
Baltimorova klasifikace virů
Skupina	VI (ssRNA viry s reverzní transkriptázou)
Vědecká klasifikace
Realm	Riboviria;
Říše	Pararnavirae;
Kmen	Artverviricota;
Třída	Revtraviricetes;
Řád	Ortervirales;
Čeleď	retroviry (Retroviridae);
podčeledi a druhy
	Orthoretrovirinae Alpharetrovirus; Betaretrovirus; Gammaretrovirus; Deltaretrovirus; Epsilonretrovirus; Lentivirus; ; Spumaretrovirinae Bovispumavirus; Equispumavirus; Felispumavirus; Prosimiispumavirus; Simiispumavirus; ;
	Některá data mohou pocházet z datové položky.

Retroviry (v užším smyslu, tj. čeleď Retroviridae) jsou obalené RNA viry s jednovláknovou nukleovou kyselinou, které jsou schopné pomocí reverzní transkriptázy přepsat svou genetickou informaci do DNA, kterou následně mohou včlenit (inzertovat) do genomu hostitelské buňky. Reverzní transkripce byla poprvé objevena právě u těchto virů, dnes je však známo více virových čeledí s touto schopností.

Retroviry jsou viry obratlovců, mají vysokou hostitelskou specifitu a u svých hostitelů vyvolávají celoživotní infekce. Podle druhu viru jsou původci nádorových onemocnění nebo napadají lymfatickou tkáň. Pro člověka je patogenní T-lymfotropní virus a virus HIV, který způsobuje syndrom získaného selhání imunity, AIDS.

V širším smyslu se jako retroviry označují veškeré viry s reverzní transkriptázou, tedy Baltimorovy skupiny VI a VII.

Popis

Baltimoreova klasifikace virů řadí retroviry (v užším smyslu, čeleď Retroviridae) do skupiny VI, mezi ssRNA viry s reverzní transkriptázou.

Viriony jsou obalené, v průměru kolem 100 nm velké, kulovitého tvaru. Kapsida uvnitř je pravděpodobně izohedrálně symetrická, z perikapsidálního obalu zralých virových částic vyčnívají na povrch glykoproteinové, asi 8 nm dlouhé peplomery, které tvoří jakési bodce pravidelně čnící z povrchu viru.

Virový genom je tvořen dvěma molekulami pozitivní jednovláknové RNA (+ssRNA), tvoří asi 2 % hmotnosti celé virové částice. Mimo této RNA se uvnitř virionu nachází také tRNA, která slouží jako primer k syntéze komplementární negativní DNA v infikované buňce, a reverzní transkriptáza a další enzymy.

Životní cyklus

Retroviry se replikují v cytoplasmě a dozrávají pučením z cytoplasmatické membrány napadené buňky. Převedením své genetické informace na dvouvláknovou DNA pomocí reverzní transkriptázy také získaly schopnost integrovat se do buněčného genomu jako tzv. provirus, neaktivní forma viru, která je však předávána všem potomkům nakažené buňky. V této formě je také dokonale chráněn před imunitním systémem hostitele – infekce retroviry je vždy doživotní, i když sama infekce nemusí nutně znamenat smrt nositele viru.

Taxonomie

V současnosti (2018) je známo 11 rodů čeledi Retroviridae ve dvou podčeledích:^[1]

Orthoretrovirinae

Alpharetrovirus; typový druh: virus leukózy drůbeže
Betaretrovirus; typový druh: virus nádoru mléčné žlázy myší
Gammaretrovirus; typový druh: virus leukémie myší
Deltaretrovirus; typový druh: virus enzootické leukózy skotu, HTLV (virus lidské T-buněčné leukémie)
Epsilonretrovirus; typový druh: virus kožních sarkomů ryb
Lentivirus; typový druh: HIV

Spumaretrovirinae

Původní jeden rod Spumavirus byl rozdělen do 5 rodů, nazvaných podle hostitelů:

Bovispumavirus; typový druh: Bovine foamy virus napadající skot
Equispumavirus; typový druh: Equine foamy virus napadající koně
Felispumavirus; typový druh: Feline foamy virus napadající kočky
Prosimiispumavirus; typový druh: Brown greater galago prosimian foamy virus napadající komby
Simiispumavirus; typový druh: Eastern chimpanzee simian foamy virus napadající šimpanze

Retroviry v širším smyslu

Do virů s reverzní transkriptázou patří (v závorce Baltimorova skupina):^[1]

Řád Ortervirales,^[2] tj. čeledi Belpaoviridae (VI), Caulimoviridae (VII), Retroviridae (VI), včetně čeledí s retrotranspozony: Metaviridae (VI) a Pseudoviridae (VI)
Čeleď (nezařazená do žádného řádu): Hepadnaviridae (VII) a jí příbuzná
Čeleď (nezařazená do žádného řádu a dosud neuznaná ICTV): Nackednaviridae^[3] (VII)

Odkazy

Reference

↑ ^a ^b International Committee on Taxonomy of Viruses, Virus Taxonomy: 2018 Release. Dostupné online Archivováno 2. 5. 2020 na Wayback Machine. (anglicky)
↑ KRUPOVIC, Mart, et al. Ortervirales: New Virus Order Unifying Five Families of Reverse-Transcribing Viruses. Journal of Virology [online]. American Society for Microbiology, 15. červen 2018. Svazek 92, čís. 12: e00515-18. Dostupné online. Dostupné také na: [1]. ISSN 1098-5514. DOI 10.1128/JVI.00515-18. PMID 29618642. (anglicky)
↑ LAUBER, Chris; SEITZ, Stefan; MATTEI, Simone; SUH, Alexander; BECK, Jürgen; HERSTEIN, Jennifer; BÖROLD, Jacob, SALZBURGER, Walter; KADERALI, Lars; BARTENSCHLAGER, Ralf; BRIGGS, John A. G. Deciphering the Origin and Evolution of Hepatitis B Viruses by Means of a Family of Non-enveloped Fish Viruses. S. 387–399.e6. Cell Host & Microbe [online]. Cell Press, Elsevier Inc., 31. srpen 2017. Svazek 22, čís. 3, s. 387–399.e6. Dostupné online. Dostupné také na: [2]. ISSN 1931-3128. DOI 10.1016/j.chom.2017.07.019. PMID 28867387. (anglicky)

Literatura

DOSTÁLKOVÁ, A; VOKATÁ, B; KAUFMAN, F; ULBRICH, P; RUML, T; RUMLOVÁ, M. Effect of Small Polyanions on In Vitro Assembly of Selected Members of Alpha-, Beta- and Gammaretroviruses. Viruses. 2021, s. 129. DOI 10.3390/v13010129. PMID 33477490.

Externí odkazy

Obrázky, zvuky či videa k tématu retroviry na Wikimedia Commons

[ICTV_2018-1] International Committee on Taxonomy of Viruses, Virus Taxonomy: 2018 Release. Dostupné online Archivováno 2. 5. 2020 na Wayback Machine. (anglicky)

[Krupovic_2018-2] KRUPOVIC, Mart, et al. Ortervirales: New Virus Order Unifying Five Families of Reverse-Transcribing Viruses. Journal of Virology [online]. American Society for Microbiology, 15. červen 2018. Svazek 92, čís. 12: e00515-18. Dostupné online. Dostupné také na: [1]. ISSN 1098-5514. DOI 10.1128/JVI.00515-18. PMID 29618642. (anglicky)

[Lauber_2017-3] LAUBER, Chris; SEITZ, Stefan; MATTEI, Simone; SUH, Alexander; BECK, Jürgen; HERSTEIN, Jennifer; BÖROLD, Jacob, SALZBURGER, Walter; KADERALI, Lars; BARTENSCHLAGER, Ralf; BRIGGS, John A. G. Deciphering the Origin and Evolution of Hepatitis B Viruses by Means of a Family of Non-enveloped Fish Viruses. S. 387–399.e6. Cell Host & Microbe [online]. Cell Press, Elsevier Inc., 31. srpen 2017. Svazek 22, čís. 3, s. 387–399.e6. Dostupné online. Dostupné také na: [2]. ISSN 1931-3128. DOI 10.1016/j.chom.2017.07.019. PMID 28867387. (anglicky)

[1]

[2]

[3]