Kabelové bakterie

bakteriální vlákna v horní vrstvě sedimentu, která vedou elektřinu na vzdálenost v řádu centimetrů.

Kabelové bakterie jsou bakterie, které vytvářejí spojené řetězce o délce až několika centimetrů složené z tisíců bakteriálních buněk; jsou proto označovány jako mnohobuněčné bakterie (nebo mnohobuněčné orgamismy)[1][2][3] Tyto řetězce bakterií pak fungují jako živé vodiče elektřiny.[4] Vyskytují se v sedimentech a podzemních vodách, kde vedou elektřinu na vzdálenosti řádově centimetrů.[5][6] Tím, že transportují elektrony na relativně velké vzdálenosti, propojují donory elektronů s akceptory elektronů, čímž propojují jinak oddělené oxidační a redukční reakce.[7] Kabelové bakterie spojují redukci kyslíku[6] nebo dusičnanů[8][9] na povrchu sedimentu s oxidací sulfidů[6] v hlubších, anoxických (= bez kyslíku) vrstvách sedimentu.

Kabelové bakterie mezi dvěma oddělenými vrstvami sedimentu uvnitř skleněného válce.
Diagram znázorňující metabolismus kabelových bakterií v povrchovém sedimentu. Sirovodík (H2S) je oxidován v sulfidické vrstvě sedimentu a uvolněné elektrony (e) jsou vedeny vzhůru vláknem kabelových bakterií do vrstvy obsahující kyslík a použity k redukci molekulárního kyslíku (O2).

Vedení elektřiny v sedimentu na relativně velkou vzdálenost bylo poprvé pozorováno v roce 2010 jako prostorová separace oxidace sulfidů a redukce kyslíku v mořském sedimentu, která byla po přerušení znovu obnovena rychleji, než by umožnila chemická difúze. [5] Později bylo zjištěno, že elektrickou vodivost lze pozorovat i na nevodivé vrstvě skleněných mikrokuliček, kde jedinými možnými vodivými strukturami byly vláknité bakterie patřící do čeledi Desulfobulbaceae . [6] Vodivost jednotlivých živých vláken byla později prokázána pozorováním oxidačního stavu cytochromů pomocí Ramanovy spektroskopie.[10] Stejný jev byl později pozorován ve sladkovodních sedimentech [11] a podzemních vodách. [12][13] V povrchové vrstvě sedimentu o tloušťce 15 cm je hustota bakterií taková, že jejich celková délka dosahuje až 2 km na čtvereční centimetr povrchu.[14]

Morfologie

editovat

Vlákna kabelových bakterií mají průměr 1–4 μm a délku přes 1 cm.[15] Jednotlivé bakterie ve vláknech jsou tyčinkovitého tvaru s průměrnou délkou 3 μm.[6] Stejně jako ostatní gramnegativní bakterie mají buněčnou stěnu tvořenou dvěma membránami, vnější membrána je však společná všem bakteriím ve vláknu.[6] Ve společné periplazmě je kolem 15–60[6][15] elektronově vodivých vláken o průměru kolem 50 nm, které jsou zvenčí viditelné jako rovnoběžná, podélná žebra. Skládají se z proteinů bohatých na nikl a síru, které jsou elektricky izolované a probíhají po celé délce vlákna.[15]

Výskyt

editovat

Kabelové bakterie byly nalezeny v různých klimatických podmínkách po celém světě.[16] Jmenovitě v Dánsku,[6][11] Nizozemsku,[17] Japonsku,[18] Austrálii[19] a USA.[20] Obecně se vyskytují v redukovaných sedimentech[21] sladkých vod, slaných jezer i mořského dna.[22][18] Vyskytují se jako jednotlivá vlákna nebo jako aglomerace vláken, mohou být přítomny v rhizosféře v kontaktu s kořenovými vlásky vodních rostlin.[21]

Pohyblivost

editovat

Kabelové bakterie postrádají bičíky, ale jsou schopné motility ve formě klouzání[23] tím, že se pohánějí dopředu pomocí vypuzování látek. [24][25] Rychlost pohybu dosahuje až 2,2 μm/s, s průměrem asi 0,5 μm/s a nezávisí na velikostí bakterií.[23] Průměrná vzdálenost, kterou kabelová bakterie klouže bez přerušení, je přibližně 74 μm.[23] Kabelové bakterie pravděpodobně využívají kyslíkovou chemotaxi, protože bylo pozorováno, že v anoxických nebo hypoxických prostředích se pohybují a při kontaktu s kyslíkem pohyb ustává.[23]

Taxonomie

editovat

V roce 2016 byly navrženy dva kandidátní rody kabelových bakterií: Electrothrix obsahující čtyři kandidátní druhy, nalezené v mořských nebo brakických sedimentech, a Electronema obsahující dva kandidátní druhy, nalezené ve sladkovodních sedimentech.[18] Na základě srovnání 16S ribozomální RNA bylo zjištěno, že obě skupiny jsou z 88 % podobné.[26] Oba rody jsou zařazeny do čeledi Desulfobulbaceae . [24] Kabelové bakterie jsou definovány spíše svou funkcí než fylogenezí a je možné, že budou objeveny další taxony kabelových bakterií.

Ekologický význam

editovat

Kabelové bakterie silně ovlivňují geochemické vlastnosti v okolním prostředí. Jejich aktivita podporuje oxidaci železa na povrchu sedimentu. Tyto oxidy následně vážou sloučeniny obsahující fosfor[27] a sirovodík,[28] čímž omezují množství fosforu a sirovodíku ve vodě. Fosfor může způsobit eutrofizaci a sirovodík může být toxický pro mořský život. Kabelové bakterie proto hrají důležitou roli při udržování mořských ekosystémů v pobřežních oblastech.

Emise metanu

editovat

Přítomnost kabelových bakterií může vést ke snížení emisí metanu z vodou nasycených půd. Přenos elektronů prostřednictvím kabelových bakterií zajišťuje, aby byla redukce síranů, ke které dochází v zaplavených půdách, vyvážena oxidací sulfidů. Díky této rovnováze zůstávají sírany snadno dostupné pro sirné bakterie, které konkurují metanogenům. Tím se produkce metanu snižuje.[29]

Potenciální aplikace

editovat

Vodivá vlákna produkovaná bakteriemi byla známa už dříve, dosahovala však délek pouze v řádu mikrometrů.[30] Vodivá vlákna v řetězcích kabelových bakterií tyto hodnoty překonávají o několik řádů. Vodivost proteinových vláken přesahuje 20 S/cm, což je srovnatelné s používanými vodivými polymery.

Předpokládá se, že by kabelové bakterie mohly najít uplatnění v bioelektronice, například k propojení anorganické elektroniky s živými systémy, pro biologicky kompatibilní nebo vstřebaelné implantáty, případně pro biodegradabilní mikroelektroniku.[1][3]

Kabelové bakterie byly nalezeny v souvislosti s mikrobiálními palivovými články, které s pomocí mikroorganismů přeměňují chemickou energii na dně oceánu na elektrickou energii.[31] V budoucnosti by mohly hrát roli při zvyšování účinnosti těchto článků. Kabelové bakterie byly také nalezeny v souvislosti s bioelektrochemickým systémem, který zvyšuje degradaci mořských sedimentů kontaminovaných uhlovodíky,[32] mohly by proto hrát roli v budoucích technologiích odstraňování následků ropných havárií.

Reference

editovat

V tomto článku byl použit překlad textu z článku Cable bacteria na anglické Wikipedii.

  1. a b BÁRTA, Jiří. Rozsáhlé bakteriální sítě „nanodrátů“ vysvětlují tajemný elektrický proud na dně oceánu. Gate2Biotech [online]. Jihočeská agentura pro podporu inovačního podnikání, 2014-07-28 [cit. 2024-10-25]. Dostupné online. ISSN 1802-2685. 
  2. MIHULKA, Stanislav. Kabelové bakterie jsou nefalšované živé elektrické vodiče - Gate2Biotech.cz. Gate2Biotech [online]. Jihočeská agentura pro podporu inovačního podnikání, 2019-09-13 [cit. 2024-10-25]. Dostupné online. 
  3. a b HOUSER, Pavel. Bakterie vytvářejí vodivé kabely. Sciencemag.cz [online]. Nitemedia, 2019-12-21 [cit. 2024-10-25]. Dostupné online. 
  4. redakce ČRo Leonardo. Živé elektrické kabely. ČRo Plus [online]. Český Rozhlas, 2012-10-26 [cit. 2024-10-25]. Dostupné online. 
  5. a b NIELSEN, Lars Peter; RISGAARD-PETERSEN, Nils; FOSSING, Henrik; CHRISTENSEN, Peter Bondo; SAYAMA, Mikio. Electric currents couple spatially separated biogeochemical processes in marine sediment. S. 1071–1074. Nature [online]. Springer Nature, 2010-02 [cit. 2024-10-25]. Roč. 463, čís. 7284, s. 1071–1074. Dostupné online. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/nature08790. Bibcode 2010Natur.463.1071N. PMID 20182510. (anglicky) 
  6. a b c d e f g h PFEFFER, Christian; LARSEN, Steffen; SONG, Jie; DONG, Mingdong; BESENBACHER, Flemming; MEYER, Rikke Louise; KJELDSEN, Kasper Urup. Filamentous bacteria transport electrons over centimetre distances. S. 218–221. Nature [online]. Springer Nature, 2012-11 [cit. 2024-10-25]. Roč. 491, čís. 7423, s. 218–221. Dostupné online. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/nature11586. PMID 23103872. (anglicky) 
  7. NIELSEN, Lars Peter; RISGAARD-PETERSEN, Nils. Rethinking Sediment Biogeochemistry After the Discovery of Electric Currents. S. 425–442. Annual Review of Marine Science [online]. 2015-01-03 [cit. 2024-10-25]. Roč. 7, čís. 1, s. 425–442. Dostupné online. DOI 10.1146/annurev-marine-010814-015708. PMID 25251266. (anglicky) 
  8. Chybí název periodika! PMID 24577351. Bibcode 6. 
  9. MARZOCCHI, Ugo; TROJAN, Daniela; LARSEN, Steffen; LOUISE MEYER, Rikke; PETER REVSBECH, Niels; SCHRAMM, Andreas; PETER NIELSEN, Lars. Electric coupling between distant nitrate reduction and sulfide oxidation in marine sediment. S. 1682–1690. The ISME Journal [online]. Oxford University Press, 2014-08-01 [cit. 2024-10-25]. Roč. 8, čís. 8, s. 1682–1690. Dostupné online. ISSN 1751-7370. DOI 10.1038/ismej.2014.19. (anglicky) 
  10. BJERG, Jesper T.; BOSCHKER, Henricus T. S.; LARSEN, Steffen; BERRY, David; SCHMID, Markus; MILLO, Diego; TATARU, Paula. Long-distance electron transport in individual, living cable bacteria. S. 5786–5791. Proceedings of the National Academy of Sciences [online]. National Academy of Sciences, 2018-05-29 [cit. 2024-10-25]. Roč. 115, čís. 22, s. 5786–5791. Dostupné online. DOI 10.1073/pnas.1800367115. PMID 29735671. (anglicky) 
  11. a b RISGAARD-PETERSEN, Nils; KRISTIANSEN, Michael; FREDERIKSEN, Rasmus B.; DITTMER, Anders Lindequist; BJERG, Jesper Tataru; TROJAN, Daniela; SCHREIBER, Lars. Cable Bacteria in Freshwater Sediments. S. 6003–6011. Applied and Environmental Microbiology [online]. American Society for Microbiology, 2015-09 [cit. 2024-10-25]. Roč. 81, čís. 17, s. 6003–6011. Dostupné online. DOI 10.1128/aem.01064-15. PMID 26116678. (anglicky) 
  12. Chybí název periodika! PMID 27058505. 
  13. MÜLLER, Hubert; BOSCH, Julian; GRIEBLER, Christian; DAMGAARD, Lars Riis; NIELSEN, Lars Peter; LUEDERS, Tillmann; MECKENSTOCK, Rainer U. Long-distance electron transfer by cable bacteria in aquifer sediments. S. 2010–2019. The ISME Journal [online]. Oxford University Press, 2016-08-01 [cit. 2024-10-25]. Roč. 10, čís. 8, s. 2010–2019. Dostupné online. DOI 10.1038/ismej.2015.250. PMID 27058505. (anglicky) 
  14. SCHAUER, Regina; RISGAARD-PETERSEN, Nils; KJELDSEN, Kasper U; TATARU BJERG, Jesper J; B JØRGENSEN, Bo; SCHRAMM, Andreas; NIELSEN, Lars Peter. Succession of cable bacteria and electric currents in marine sediment. S. 1314–1322. The ISME Journal [online]. Oxford University Press, 2014-06-01 [cit. 2024-10-25]. Roč. 8, čís. 6, s. 1314–1322. DOI 10.1038/ismej.2013.239. PMID 24451206. (anglicky) 
  15. a b c BOSCHKER, Henricus T. S.; COOK, Perran L. M.; POLERECKY, Lubos; EACHAMBADI, Raghavendran Thiruvallur; LOZANO, Helena; HIDALGO-MARTINEZ, Silvia; KHALENKOW, Dmitry. Efficient long-range conduction in cable bacteria through nickel protein wires. Nature Communications [online]. Springer Nature, 2021-06-28 [cit. 2024-10-25]. Roč. 12, čís. 1. Dostupné online. ISSN 2041-1723. DOI 10.1038/s41467-021-24312-4. (anglicky) 
  16. BURDORF, Laurine D. W.; TRAMPER, Anton; SEITAJ, Dorina; MEIRE, Lorenz; HIDALGO-MARTINEZ, Silvia; ZETSCHE, Eva-Maria; BOSCHKER, Henricus T. S. Long-distance electron transport occurs globally in marine sediments. S. 683–701. Biogeosciences [online]. European Geosciences Union, 2017-02-10 [cit. 2024-10-25]. Roč. 14, čís. 3, s. 683–701. Dostupné online. DOI 10.5194/bg-14-683-2017. Bibcode 2017BGeo...14..683B. (anglicky) 
  17. MALKIN, Sairah Y; RAO, Alexandra M F; SEITAJ, Dorina; VASQUEZ-CARDENAS, Diana; ZETSCHE, Eva-Maria; HIDALGO-MARTINEZ, Silvia; BOSCHKER, Henricus T S. Natural occurrence of microbial sulphur oxidation by long-range electron transport in the seafloor. S. 1843–1854. The ISME Journal [online]. Oxford University Press, 2014-09-01 [cit. 2024-10-25]. Roč. 8, čís. 9, s. 1843–1854. Dostupné online. ISSN 1751-7370. DOI 10.1038/ismej.2014.41. PMID 24671086. (anglicky) 
  18. a b c TROJAN, Daniela; SCHREIBER, Lars; BJERG, Jesper T.; BØGGILD, Andreas; YANG, Tingting; KJELDSEN, Kasper U.; SCHRAMM, Andreas. A taxonomic framework for cable bacteria and proposal of the candidate genera Electrothrix and Electronema. S. 297–306. Systematic and Applied Microbiology [online]. Elsevier, 2016-07 [cit. 2024-10-25]. Roč. 39, čís. 5, s. 297–306. Dostupné online. DOI 10.1016/j.syapm.2016.05.006. PMID 27324572. (anglicky) 
  19. KESSLER, Adam J.; WAWRYK, Michaela; MARZOCCHI, Ugo; ROBERTS, Keryn L.; WONG, Wei Wen; RISGAARD‐PETERSEN, Nils; MEYSMAN, Filip J. R. Cable bacteria promote DNRA through iron sulfide dissolution. S. 1228–1238. Limnology and Oceanography [online]. Association for the Sciences of Limnology and Oceanography, 2019-05 [cit. 2024-10-25]. Roč. 64, čís. 3, s. 1228–1238. Dostupné online. DOI 10.1002/lno.11110. (anglicky) 
  20. LARSEN, Steffen; NIELSEN, Lars Peter; SCHRAMM, Andreas. Cable bacteria associated with long‐distance electron transport in N ew E ngland salt marsh sediment. S. 175–179. Environmental Microbiology Reports [online]. John Wiley & Sons, 2015-04 [cit. 2024-10-25]. Roč. 7, čís. 2, s. 175–179. Dostupné online. DOI 10.1111/1758-2229.12216. PMID 25224178. 
  21. a b SCHOLZ, Vincent V; MÜLLER, Hubert; KOREN, Klaus; NIELSEN, Lars Peter; MECKENSTOCK, Rainer U. The rhizosphere of aquatic plants is a habitat for cable bacteria. FEMS Microbiology Ecology [online]. Federation of European Microbiological Societies, 2019-06-01 [cit. 2024-10-25]. Roč. 95, čís. 6. Dostupné online. ISSN 1574-6941. DOI 10.1093/femsec/fiz062. PMID 31054245. (anglicky) 
  22. RISGAARD-PETERSEN, Nils; KRISTIANSEN, Michael; FREDERIKSEN, Rasmus B.; DITTMER, Anders Lindequist; BJERG, Jesper Tataru; TROJAN, Daniela; SCHREIBER, Lars. Cable Bacteria in Freshwater Sediments. S. 6003–6011. Applied and Environmental Microbiology [online]. American Society for Microbiology, 2015-09 [cit. 2024-10-25]. Roč. 81, čís. 17, s. 6003–6011. Dostupné online. DOI 10.1128/AEM.01064-15. PMID 26116678. (anglicky) 
  23. a b c d BJERG, Jesper Tataru; DAMGAARD, Lars Riis; HOLM, Simon Agner; SCHRAMM, Andreas; NIELSEN, Lars Peter. Motility of Electric Cable Bacteria. S. 3816–3821. Applied and Environmental Microbiology [online]. American Society for Microbiology, 2016-07 [cit. 2024-10-25]. Roč. 82, čís. 13, s. 3816–3821. Dostupné online. DOI 10.1128/AEM.01038-16. PMID 27084019. (anglicky) 
  24. a b Chybí název periodika! PMID 31427514. Bibcode 6. 
  25. KJELDSEN, Kasper U.; SCHREIBER, Lars; THORUP, Casper A.; BOESEN, Thomas; BJERG, Jesper T.; YANG, Tingting; DUEHOLM, Morten S. On the evolution and physiology of cable bacteria. S. 19116–19125. Proceedings of the National Academy of Sciences [online]. National Academy of Sciences, 2019-09-17 [cit. 2024-10-25]. Roč. 116, čís. 38, s. 19116–19125. Dostupné online. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1903514116. PMID 31427514. (anglicky) 
  26. MEYSMAN, Filip J.R. Cable Bacteria Take a New Breath Using Long-Distance Electricity. S. 411–422. Trends in Microbiology [online]. Elsevier, 2018-05 [cit. 2024-10-25]. Roč. 26, čís. 5, s. 411–422. Dostupné online. DOI 10.1016/j.tim.2017.10.011. PMID 29174100. 
  27. SULU-GAMBARI, Fatimah; SEITAJ, Dorina; MEYSMAN, Filip J. R.; SCHAUER, Regina; POLERECKY, Lubos; SLOMP, Caroline P. Cable Bacteria Control Iron–Phosphorus Dynamics in Sediments of a Coastal Hypoxic Basin. S. 1227–1233. Environmental Science & Technology [online]. American Chemical Society, 2016-02-02 [cit. 2024-10-25]. Roč. 50, čís. 3, s. 1227–1233. Dostupné online. DOI 10.1021/acs.est.5b04369. PMID 26720721. (anglicky) 
  28. SEITAJ, Dorina; SCHAUER, Regina; SULU-GAMBARI, Fatimah; HIDALGO-MARTINEZ, Silvia; MALKIN, Sairah Y.; BURDORF, Laurine D. W.; SLOMP, Caroline P. Cable bacteria generate a firewall against euxinia in seasonally hypoxic basins. S. 13278–13283. Proceedings of the National Academy of Sciences [online]. National Academy of Sciences, 2015-10-27 [cit. 2024-10-25]. Roč. 112, čís. 43, s. 13278–13283. Dostupné online. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1510152112. PMID 26446670. (anglicky) 
  29. SCHOLZ, Vincent V.; MECKENSTOCK, Rainer U.; NIELSEN, Lars Peter; RISGAARD-PETERSEN, Nils. Cable bacteria reduce methane emissions from rice-vegetated soils. Nature Communications [online]. Springer Nature, 2020-04-20 [cit. 2024-10-25]. Roč. 11, čís. 1. Dostupné online. ISSN 2041-1723. DOI 10.1038/s41467-020-15812-w. PMID 32313021. (anglicky) 
  30. Drobounké bakterie vhodné pro vodivé elektrické kabely. Technický týdeník [online]. Business Media, 2006-01-01 [cit. 2024-10-25]. Dostupné online. 
  31. REIMERS, Clare E.; LI, Cheng; GRAW, Michael F.; SCHRADER, Paul S.; WOLF, Michael. The Identification of Cable Bacteria Attached to the Anode of a Benthic Microbial Fuel Cell: Evidence of Long Distance Extracellular Electron Transport to Electrodes. Frontiers in Microbiology [online]. Frontiers Media, 2017-10-24 [cit. 2024-10-25]. Roč. 8. Dostupné online. DOI 10.3389/fmicb.2017.02055. PMID 29114243. (anglicky) 
  32. MATTURRO, Bruna; CRUZ VIGGI, Carolina; AULENTA, Federico; ROSSETTI, Simona. Cable Bacteria and the Bioelectrochemical Snorkel: The Natural and Engineered Facets Playing a Role in Hydrocarbons Degradation in Marine Sediments. Frontiers in Microbiology [online]. Frontiers Media, 2017-05-29 [cit. 2024-10-25]. Roč. 8. Dostupné online. DOI 10.3389/fmicb.2017.00952. PMID 28611751. (anglicky)