iNaturalist

projekt občanské vědy

iNaturalist je sociální síť a aplikace pro určování organismů a soustředění záznamů o jejich výskytu. Jde o projekt občanské vědy, do sběru dat se tedy může zapojit nejen vědecká komunita ale především široká veřejnost.[1][2] Pozorování je možné vkládat prostřednictvím webové stránky nebo mobilní aplikace ve formě fotografií nebo zvukových nahrávek.[3][4] Zaznamenaná pozorování pak slouží jako cenná otevřená data (tzv. open source) pro řadu výzkumných projektů, muzeí, botanických zahrad, parků a dalších organizací.[5][6][7]

iNaturalist
ZřizovatelCalifornia Academy of Sciences
ZakladatelNate Agrin, Jessica Kline, Ken-ichi Ueda
Vznik2008
Právní formaorganizace podle 26 U.S.C. § 501(c)(3)
Oficiální webwww.inaturalist.org
Logo Wikimedia Commons multimediální obsah na Commons
Některá data mohou pocházet z datové položky.

Historie

editovat

iNaturalist.org byl založen v roce 2008 a vznikl jako závěrečná magisterská práce studentů Nate Agrin, Jessica Kline a Ken-ichi Ueda z Kalifornské univerzity v Berkeley.[2][8] Nate Agrin a Ken-ichi Ueda pokračovali v budování stránky s webovým vývojářem Seanem McGregorem.[2] V roce 2011 začal Ueda spolupracovat se Scottem Loariem, výzkumníkem na Stanfordově univerzitě a vyučujícím na Kalifornské univerzitě v Berkeley. Ueda a Loarie v současnosti iNaturalist.org společně řídí. 24. dubna 2014 byl iNaturalist.org sloučen se stránkami Kalifornské akademie věd.[9]

V roce 2014 iNaturalist oslavil milionté pozorování[10] a v roce 2020 překonala aplikace milník 50 milionů pozorování od více než milionu uživatelů.[11]

Využití aplikace a jejích dat

editovat
 
Zobrazení polohy záznamů pozorování uložených do aplikace iNaturalist z léta roku 2021.

Aby bylo možné data z iNaturalistu dále použít, vyžaduje každé pozorování u identifikace organismu ověření několika členy komunity.[12] Komunitou ověřená pozorování z iNaturalistu jsou následně sdílena s významnými datovými úložišti jako Global Biodiversity Information Facility (GBIF), odkud je možné data stáhnout a využít. iNaturalist byl v roce 2020 nejcitovanějším datasetem získávaným právě z této platformy.[11]

Nevýhodou dat z aplikace je přirozeně větší zaměření uživatelů na mapování hlavně městského prostředí a často navštěvovaných atraktivních přírodních lokalit. Distribuce záznamů z aplikace tak není prostorově rovnoměrná.[13] Na druhou stranu umožňuje aplikace získat i záznamy ze soukromých pozemků, kam by jinak výzkumníci neměli přístup.[14] Uživatelé se také primárně orientují na charismatické organismy s denní aktivitou, iNaturalist tak poskytuje mnohem méně dat o organismech s noční aktivitou nebo malých a rychle se pohybujících organismech.[15][16]

Jelikož aplikace využívá algoritmů srovnávajících fotografie za účelem identifikace objektů v nich (resp. poskytnutí návrhu identifikátoru, jde o tzv. computer vision model),[17][18] je tedy závislá na množství vložených fotografií jednotlivých druhů, které umožňují další učení umělé inteligence v jejich rozpoznávání[18]. Z tohoto důvodu není část druhů organismů spolehlivě identifikovatelná pouze za využití algoritmu aplikace a vyžaduje i spolupráci uživatelů, odborníků na daný taxon.[18][16]

Odborné publikace

editovat

Vědecká komunita využívá data z aplikace v různých kontextech. Ať už jde o mapování biodiverzity, získání informací k podpoře ochrany přírody nebo nálezy nových druhů.[19] Často jde ale hlavně o získání záznamů o rozšíření nebo návratu druhů už známých do nových biotopů nebo zemí[8][11][20], včetně informací o druzích ohrožených[13][21] a sledování šíření invazních druhů[22][23]. Diskutuje se i o získání dalších dat z uložených fotografií například o interakci mezi organismy (např. mezi rostlinami a jejich opylovači[24] nebo monitoring parazitů a onemocnění, včetně hospodářsky významných[25][26][27]).

Sami uživatelé aplikace také společně sestavují seznam vědeckých publikací, která citují iNaturalist jako zdroj dat, zahrnující již desítky odborných článků.[28][29] (Včetně např. publikace zabývající se reakcí velkých savců na snížení aktivity lidí ve městech během pandemie covidu.[30])

Význam ve vzdělávání

editovat

iNaturalist je využíván i pro vzdělávací a osvětové účely. Jeho využití ve výuce oceňují studenti jako zapojení interaktivních moderních technologií, netradiční prostředek výuky i možnost výuky venku.[31][32][33] iNaturalist má ale i potenciál podpořit všímavost v přírodě, nadšení pro poznávání a určování druhů a povědomí o méně charismatických druzích organismů v bezprostředním okolí žáků a studentů.[34][35][36][37] U vysokoškolských studentů podporuje schopnost zaznamenávání a následné práce s daty.[35] Je možné ho používat pro vytváření digitálních herbářů.[31][33]

Na druhou stranu díky automatickému určení druhu nepodporuje v učení se poznávacích znaků organismů.[38] Studenti také mají tendenci pořizovat pozorování druhů v zajetí místo divokých.[37] Větší potenciál získat statut ověřeného a tedy pro vědecké účely využitelného pozorování mají pak příspěvky od starších zapojených (16-19 let).[12]

City Nature Challenge

editovat
 
Používání mobilní aplikace iNaturalist v terénu

City Nature Challenge je několikadenní akce v rámci iNaturalist zaměřená na mapování biodiverzity urbanizovaného prostředí a slouží také jako jeden z významných nástrojů propagace aplikace. Akce začala v roce 2016 jako osmidenní přátelské klání mezi americkými městy Los Angeles a San Francisko, již v roce 2017 se ale rozšířila po celých Spojených státech a v roce 2018 do zbytku světa.[39]

Akci zajišťují týmy zaměřené na občanskou vědu z Kalifornské akademie věd (California Academy of Sciences) a Muzea přírodní historie v Los Angeles (Natural History Museum of Los Angeles County). Celosvětové klání trvá čtyři dny a je organizované pravidelně na konci dubna. Cílem je získat co nejvíce pozorování, sledovaných druhů organismů a zapojených uživatelů na území daného města a poukázat tak na nečekaně velkou rozmanitost urbanizovaného prostředí skrze přátelskou soutěž.[40]

Celosvětově se v roce 2022 zúčastnilo klání 445 měst ve 47 zemích světa a získáno bylo přes 1,6 milionu pozorování více než 50 tisíc druhů organismů.[41]

Organizace v ČR

editovat

Česko je do akce City Nature Challenge zapojené od roku 2018 díky Národnímu muzeu v Praze, které akci v hlavním městě zaštiťuje s podporou dalších organizací (jako AOPK ČR, Česká botanická společnost, Lesy hl. m. Prahy, portál BioLib.cz, PřF UK a další).[42] Prvním zapojeným městem byla Praha a v dalších letech následovaly postupně Brno (pod záštitou Hvězdárny a planetária Brno v roce 2020[43][44][45]), Uherské Hradiště (pod záštitou UTB v roce 2021[46]) a České Budějovice (pod záštitou Biologického centra AV ČR v roce 2022[47][48][49]). Cílem akce je v ČR i pravidelně organizovaná osvěta formou exkurzí[50][47] a zapojení široké veřejnosti do mapování městské přírody. Odezva na tuto akci a motivace účastníků byla v roce 2020 mapována dotazníkovým šetřením, které zjistilo, že motivace českých uživatelů je především v možnosti určit jimi pozorované druhy a poznat díky aplikaci druhy nové.[51]

Externí odkazy

editovat

Reference

editovat
  1. JILL, Nugent. iNaturalist: Citizen science for 21st-century naturalists. Science Scope [online]. Washington: National Science Teachers Association [cit. 2023-04-17]. Dostupné online. 
  2. a b c About · iNaturalist. iNaturalist [online]. [cit. 2023-04-17]. Dostupné online. 
  3. iNaturalist application (iTunes Store) [online]. 25 June 2013 [cit. 2013-08-07]. Dostupné online. 
  4. iNaturalist application (Google Play) [online]. 4 June 2013 [cit. 2013-08-07]. Dostupné online. 
  5. Encyclopedia of Life and iNaturalist work together to support citizen science [online]. 18 June 2012 [cit. 2013-08-07]. Dostupné online. 
  6. Bowser, A., Wiggins, A., Shanley, L., Preece, J., & Henderson, S. Sharing data while protecting privacy in citizen science. Interactions. 2014, s. 70–73. Dostupné v archivu pořízeném dne 2014-12-28. 
  7. Pimm, S. The biodiversity of species and their rates of extinction, distribution, and protection. www.sciencemag.org. 30 May 2014. Dostupné online [cit. 31 January 2015]. 
  8. a b WILLS, Matthew. iNaturalist and Crowdsourcing Natural History. daily.jstor.org [online]. 2020-09-16 [cit. 2023-04-17]. Dostupné online. 
  9. California Academy of Sciences Acquires iNaturalist [online]. 14 May 2014 [cit. 2014-05-14]. Dostupné v archivu pořízeném dne 17-05-2014. 
  10. Citizen scientist site hits one million observations of life on Earth. Mongabay Environmental News [online]. 2014-11-10 [cit. 2023-04-17]. Dostupné online. (anglicky) 
  11. a b c PARKING, Directions &; (415) 379-8000. Global nature observation network iNaturalist surpasses 50 million wild plant and animal observations. California Academy of Sciences [online]. [cit. 2023-04-17]. Dostupné online. (anglicky) 
  12. a b ARISTEIDOU, Maria; HERODOTOU, Christothea; BALLARD, Heidi L. How Do Young Community and Citizen Science Volunteers Support Scientific Research on Biodiversity? The Case of iNaturalist. Diversity. 2021-07, roč. 13, čís. 7, s. 318. Dostupné online [cit. 2023-04-17]. ISSN 1424-2818. DOI 10.3390/d13070318. (anglicky) 
  13. a b MESAGLIO, Thomas; CALLAGHAN, Corey T. An overview of the history, current contributions and future outlook of iNaturalist in Australia. Wildlife Research. 2021-03-19, roč. 48, čís. 4. Dostupné online. DOI 10.1071/WR20154. 
  14. MESAGLIO, Thomas; SOH, Aaron; KURNIAWIDJAJA, Steven. ‘First Known Photographs of Living Specimens’: the power of iNaturalist for recording rare tropical butterflies. Journal of Insect Conservation. 2021-12-01, roč. 25, čís. 5, s. 905–911. Dostupné online [cit. 2023-04-17]. ISSN 1572-9753. DOI 10.1007/s10841-021-00350-7. (anglicky) 
  15. Who observes the observers? Scientists conduct large-scale study of iNaturalist users. Research News [online]. 2021-09-08 [cit. 2023-04-17]. Dostupné online. (anglicky) 
  16. a b Debora Barbato, Andrea Benocci, Mirko Guasconi, Giuseppe Manganelli. Light and shade of citizen science for less charismatic invertebrate groups: quality assessment of iNaturalist nonmarine mollusc observations in central Italy. Journal of Molluscan Studies. Roč. 84, čís. 4. DOI 10.1093/mollus/eyab033. 
  17. UEDA, Ken-ichi. An Overview of Computer Vision in iNaturalist.. Biodiversity Information Science and Standards. 2020-10-01, čís. November 2014. Dostupné online [cit. 2023-04-17]. (English) 
  18. a b c VAN HORN, Grant; MAC AODHA, Oisin; SONG, Yang. The INaturalist Species Classification and Detection Dataset. In: [s.l.]: [s.n.], 2018. Dostupné online. S. 8769–8778.
  19. CALLAGHAN, Corey T.; MESAGLIO, Thomas; ASCHER, John S. The benefits of contributing to the citizen science platform iNaturalist as an identifier. PLOS Biology. 10. 11. 2022, roč. 20, čís. 11, s. e3001843. Dostupné online [cit. 2023-04-17]. ISSN 1545-7885. DOI 10.1371/journal.pbio.3001843. PMID 36355752. (anglicky) 
  20. O projektu – City Nature Challenge [online]. [cit. 2023-04-17]. Dostupné online. 
  21. WILSON, Joseph S.; PAN, Aaron D.; GENERAL, David Emmanuel M. More eyes on the prize: an observation of a very rare, threatened species of Philippine Bumble bee, Bombus irisanensis, on iNaturalist and the importance of citizen science in conservation biology. Journal of Insect Conservation. 2020-08-01, roč. 24, čís. 4, s. 727–729. Dostupné online [cit. 2023-04-17]. ISSN 1572-9753. DOI 10.1007/s10841-020-00233-3. (anglicky) 
  22. PAWSON, S. M.; SULLIVAN, J. J.; GRANT, A. Expanding general surveillance of invasive species by integrating citizens as both observers and identifiers. Journal of Pest Science. 2020-09-01, roč. 93, čís. 4, s. 1155–1166. Dostupné online [cit. 2023-04-17]. ISSN 1612-4766. DOI 10.1007/s10340-020-01259-x. (anglicky) 
  23. WERENKRAUT, Victoria; BAUDINO, Florencia; ROY, Helen E. Citizen science reveals the distribution of the invasive harlequin ladybird (Harmonia axyridis Pallas) in Argentina. Biological Invasions. 2020-10-01, roč. 22, čís. 10, s. 2915–2921. Dostupné online [cit. 2023-04-17]. ISSN 1573-1464. DOI 10.1007/s10530-020-02312-7. (anglicky) 
  24. GAZDIC, Milan; GROOM, Quentin. iNaturalist is an Unexploited Source of Plant-Insect Interaction Data.. Biodiversity Information Science and Standards. 2019-06-21, čís. 41. Dostupné online [cit. 2023-04-17]. (English) 
  25. SZENTIVANYI, Tamara; VINCZE, Orsolya. Tracking wildlife diseases using community science: an example through toad myiasis. European Journal of Wildlife Research. 2022-11-10, roč. 68, čís. 6, s. 74. Dostupné online [cit. 2023-04-17]. ISSN 1439-0574. DOI 10.1007/s10344-022-01623-5. (anglicky) 
  26. DIPROSE, Gradon; KANNEMEYER, Robyn; EDWARDS, Peter. Participatory biosecurity practices: Myrtle rust an unwanted pathogen in Aotearoa New Zealand. New Zealand Geographer. 2022-12, roč. 78, čís. 3, s. 175–185. Dostupné online [cit. 2023-04-17]. ISSN 0028-8144. DOI 10.1111/nzg.12347. (anglicky) 
  27. CULL, Benjamin. Potential for online crowdsourced biological recording data to complement surveillance for arthropod vectors. PLOS ONE. 30. 4. 2021, roč. 16, čís. 4, s. e0250382. Dostupné online [cit. 2023-04-17]. ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0250382. PMID 33930066. (anglicky) 
  28. Published papers that use iNaturalist data - wiki 1 (up to 2019). iNaturalist Community Forum [online]. 2022-11-12 [cit. 2023-04-17]. Dostupné online. 
  29. Published papers that use iNaturalist data - wiki 2 (2020 and 2021). iNaturalist Community Forum [online]. 2023-03-23 [cit. 2023-04-17]. Dostupné online. 
  30. VARDI, Reut; BERGER-TAL, Oded; ROLL, Uri. iNaturalist insights illuminate COVID-19 effects on large mammals in urban centers. Biological Conservation. 2021-02-01, roč. 254, s. 108953. Dostupné online [cit. 2023-04-17]. ISSN 0006-3207. DOI 10.1016/j.biocon.2021.108953. (anglicky) 
  31. a b ECHEVERRIA, Andres; ARIZ, Idoia; MORENO, Judit. Learning Plant Biodiversity in Nature: The Use of the Citizen–Science Platform iNaturalist as a Collaborative Tool in Secondary Education. Sustainability. 2021-01, roč. 13, čís. 2, s. 735. Dostupné online [cit. 2023-04-17]. ISSN 2071-1050. DOI 10.3390/su13020735. (anglicky) 
  32. GASS, Susan; MUI, Amy; MANNING, Paul. Exploring the value of a BioBlitz as a biodiversity education tool in a post-secondary environment. Environmental Education Research. 2021-10-03, roč. 27, čís. 10, s. 1538–1556. Dostupné online [cit. 2023-04-17]. ISSN 1350-4622. DOI 10.1080/13504622.2021.1960953. 
  33. a b ECHEVERRÍA OBANOS, Andrés; ARIZ, Idoia; MORENO ECHEVERRÍA, Judit. Learning plant biodiversity in nature: the use of the citizen–science platform iNaturalist as a collaborative tool in secondary education. academica-e.unavarra.es. 2021. Dostupné online [cit. 2023-04-17]. ISSN 2071-1050. DOI 10.3390/su13020735. 
  34. NIEMILLER, K. Denise Kendall; DAVIS, Mark A.; NIEMILLER, Matthew L. Addressing ‘biodiversity naivety’ through project-based learning using iNaturalist. Journal for Nature Conservation. 2021-12-01, roč. 64, s. 126070. Dostupné online [cit. 2023-04-17]. ISSN 1617-1381. DOI 10.1016/j.jnc.2021.126070. (anglicky) 
  35. a b HITCHCOCK, C.; SULLIVAN, J.; O'DONNELL, K. Cultivating bioliteracy, biodiscovery, data literacy, and ecological monitoring in undergraduate courses with iNaturalist. hdl.handle.net. 2021. Dostupné online [cit. 2023-04-17]. ISSN 2057-4991. DOI 10.5334/CSTP.439. (anglicky) 
  36. MECH, Angela; ROSENBERGER, Derek; FANNING, Philip. There's an app for that: Teaching entomology in the online age. Natural Sciences Education. 2022-01, roč. 51, čís. 2. Dostupné online [cit. 2023-04-17]. ISSN 2168-8273. DOI 10.1002/nse2.20081. (anglicky) 
  37. a b HERNAWATI, D., D. M. Chaidir, V. Meylani. The use of iNaturalist on learning courses of zoology vertebrates for prospective biology teachers. Journal of Physics: Conference Series. 2020, roč. 1440. Dostupné online. DOI 10.1088/1742-6596/1440/1/012064. 
  38. MCNAIR, Mason C.; SEXTON, Chelsea M.; ZENOBLE, Mark. Emphasis on quality in iNaturalist plant collections enhances learning and research utility. [s.l.]: [s.n.] Dostupné online. DOI 10.1101/2023.01.24.525445v1.abstract. S. 2023.01.24.525445. (anglicky) Type: article. 
  39. About. www.citynaturechallenge.org [online]. [cit. 2023-04-17]. Dostupné online. 
  40. PARKING, Directions &; (415) 379-8000. City Nature Challenge. California Academy of Sciences [online]. [cit. 2023-04-17]. Dostupné online. (anglicky) 
  41. www.citynaturechallenge.org [online]. [cit. 2023-04-17]. Dostupné online. 
  42. IVO, Macek; CALTOVÁ, Petra. City Nature Challenge. Journal of the National Museum (Prague). 2019, roč. 188. Dostupné online. DOI 10.2478/jnmpnhs-2019-0010. 
  43. Vzhůru do brněnské džungle, láká hvězdárna. Fotky mohou pomoct vědě. iDNES.cz [online]. 2021-04-26 [cit. 2023-04-17]. Dostupné online. 
  44. Vyrazte na „lov“ do brněnské džungle a pochlubte se světu přírodou kolem nás [online]. 2020-04-21 [cit. 2023-04-17]. Dostupné online. 
  45. HREF=,
    Autor: <a. Chcete se odreagovat? Zapojte se do mezinárodní soutěže City Nature Challenge 2020. Ekolist.cz [online]. 2020-04-20 [cit. 2023-04-17]. Dostupné online.
     
  46. Do mezinárodní výzvy City Nature Challenge se letos poprvé zapojuje také UTB [online]. 2021-04-29 [cit. 2023-04-17]. Dostupné online. 
  47. a b O víkendu foťte přírodu ve městě, začíná soutěž City Nature Challenge - Akademie věd České republiky. www.avcr.cz [online]. [cit. 2023-04-17]. Dostupné online. 
  48. BIOLOGY CENTRE CAS | City Nature Challenge 2022 results. www.bc.cas.cz [online]. [cit. 2023-04-17]. Dostupné online. 
  49. BIOLOGICKÉ CENTRUM AV ČR, v. v. i. | České Budějovice se poprvé zapojí do City Nature Challenge. www.bc.cas.cz [online]. [cit. 2023-04-17]. Dostupné online. 
  50. Exkurze – City Nature Challenge [online]. [cit. 2023-04-17]. Dostupné online. 
  51. CALTOVÁ, Petra; TYMR, František; KULHAVÁ, Zdeňka. Občanská věda: její význam a motivace účastníků v návaznosti na projekt City Nature Challenge. Journal of the National Museum (Prague), Natural History Series. 2020, roč. 189, čís. 1, s. 49–64. Dostupné online [cit. 2021-01-10]. ISSN 1802-6850. DOI 10.37520/jnmpnhs.2020.006.