DNA ligáza
DNA ligáza je enzym ze skupiny ligáz, který se účastní replikace DNA (spojování Okazakiho fragmentů), crossing-overu a opravy DNA. Katalyzuje vznik fosfodiesterové vazby v místech, kde došlo k porušení celistvosti vlákna DNA.[1]
Klasifikace
editovatJe známo více různých DNA ligáz, a to ve všech doménách života. Jako kofaktor využívají bakteriální DNA ligázy buď NAD nebo ATP, zato virové, archebakteriální a eukaryotické DNA ligázy využívají až na malé výjimky pouze ATP.[1] U živočichů známe tyto DNA ligázy:
- DNA ligáza I - nejvýznamnější[2]
- DNA ligáza II, DNA ligáza III, DNA ligáza IV - méně významné[2]
Špatná funkce DNA ligáz může vyústit v Bloomův syndrom nebo v akutní lymfoblastickou leukémii.[2]
Využití ve výzkumu
editovatCelá řada DNA ligáz byla izolována a dnes jsou neodmyslitelnou součástí experimentů v oblasti genového inženýrství. Nejčastěji užívaným enzymem z této skupiny je T4 DNA ligáza, která byla získána z buněk E. coli, jež byly infikovány fágem T4. Má sice optimum při 37 °C, ale nejlepších výsledků se dosahuje při teplotách kolem 4–16 °C, kdy je omezen tepelný pohyb molekul DNA. Vědci ji zpravidla používají pro kovalentní propojení tzv. kohezních konců (konců s jednovláknovými přesahy, jež spolu vzájemně párují), nicméně do jisté míry se dá použít i pro ligaci konců tupých.[3]
Odkazy
editovatReference
editovat- ↑ a b Alan E. Tomkinson ; John B. Leppard. ENCYCLOPEDIA OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, FOUR-VOLUME SET, 1-4. Příprava vydání Lennarz,W.J., Lane, M.D.. [s.l.]: [s.n.] Kapitola DNA Ligases: Mechanism and Function.
- ↑ a b c RÉDEI, George P. Encyclopedia of Genetics, Genomics, Proteomics, and Informatics. 3rd Edition. vyd. [s.l.]: Springer, 2008. ISBN 978-1-4020-6753-2.
- ↑ NICHOLL, Desmond S. T. An Introduction to Genetic Engineering. 3. vyd. [s.l.]: Cambridge University Press, 2008.
Související články
editovatExterní odkazy
editovat
Obrázky, zvuky či videa k tématu DNA ligáza na Wikimedia Commons
